阿弥陀佛

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险峰

一直从事气象预报、服务建模实践应用。注重气象物理场、实况场、地理信息、本体知识库、分布式气象内容管理系统建立。对Barnes客观分析, 小波,计算神经网络、信任传播、贝叶斯推理、专家系统、网络本体语言有一定体会。一直使用Java、Delphi、Prolog、SQL编程。

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nco操作参考(未完待续)

2010-06-11 09:14:20| 分类： netcdf | 标签： |举报 |字号大中小订阅

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参见： http://nco.sourceforge.net/nco.html
一. 概述
       nco----netCDF Operators，是一组命令行方式处理netCDF文件集的套装软件。可运行于几乎所有的操作系统环境。1997年的最初资助项目者是 NCA（美国航空航天局）和 ARM 公司。目前（2010-4，ver 4.0.1）支持netCDF2/3/4和HDF4/5。
二. 概念区分
     添加(Appending)是针对变量的。
            file1 = T,U,V
            file2 = P,C
            file3 = T,U,V,P,C
       连接(Concatenation)是针对（如：时间）维度的。
           file1 = T(0-12,:,:)
           file2 = T(13-24,:,:)
           file3 = T(0-24,:,:)
三. 特征参数(Features)
     1. 指定输入文件（-n,-p）
        适用于 (-n): ncea, ncecat, ncra, ncrcat
      适用于 (-p): All operators
        短选项: ‘-n’, ‘-p’
        长选项: ‘--nintap’, ‘--pth’, ‘--path’
        例如：
             ncra 85.nc 86.nc 87.nc 88.nc 89.nc 8589.nc
             ncra 8[56789].nc 8589.nc
             ncra -p input-path 85.nc 86.nc 87.nc 88.nc 89.nc 8589.nc
             ncra -n 5,2,1 85.nc 8589.nc
      2. 指定输出文件（-o）
         适用于 : All operators
         短选项: ‘-o’
         长选项: ‘--fl_out’, ‘--output’
     3. 远程获取（-p,-l）
         适用于: All operators
         短选项: ‘-p’, ‘-l’
         长选项: ‘--pth’, ‘--path’, ‘--lcl’, ‘--local’
         例如：
             ncks -l . ftp://dust.ess.uci.edu/pub/zender/nco/in.nc
             ncks -l . sftp://dust.ess.uci.edu:/home/ftp/pub/zender/nco/in.nc
             ncks -l . dust.ess.uci.edu:/home/zender/nco/data/in.nc
             ncks -l . /ZENDER/nco/in.nc

             ncks -l . mss:/ZENDER/nco/in.nc
             ncks -l . http://dust.ess.uci.edu/cgi-bin/dods/nph-dods/dodsdata/in.nc 
             或者
             ncks -p ftp://dust.ess.uci.edu/pub/zender/nco -l . in.nc
             ncks -p sftp://dust.ess.uci.edu:/home/ftp/pub/zender/nco -l . in.nc
             ncks -p dust.ess.uci.edu:/home/zender/nco -l . in.nc
             ncks -p /ZENDER/nco -l . in.nc 
             ncks -p mss:/ZENDER/nco -l . in.nc
             ncks -p http://dust.ess.uci.edu/cgi-bin/dods/nph-dods/dodsdata -l . in.nc
            对于OPeNDAP服务器
            % ncks -o ~/foo.nc -C -H -v one -l /tmp -p http://dust.ess.uci.edu/cgi-bin/dods/nph-dods/dodsdata in.nc
            one = 1
            % ncks -H -v one ~/foo.nc
            one = 1
           ncwa -C -a lat,lon,time -d lon,-10.,10. -d lat,-10.,10. -l /tmp -p \
           http://www.esrl.noaa.gov/psd/thredds/dodsC/Datasets/ncep.reanalysis.dailyavgs/surface pres.sfc.1969.nc ~/foo.nc
 4. 保留取回的文件（-R）
 适用于: All operators
 短选项: ‘-R’
 长选项: ‘--rtn’, ‘--retain’
 例如： 
 ncks -R -p ftp://weather.edu/pub/pix/jpeg -l . storm.jpg
 5. 选择输出文件格式（-3，-4）
 适用于: ncap2, ncbo, ncea,ncecat, ncflint, ncks, ncpdq,ncra, ncrcat, ncwa
 短选项: ‘-3’, ‘-4’
 长选项: ‘--3’, ‘--4’, ‘--64bit’, ‘--fl_fmt’,‘--netcdf4’
6. 变量子集（-v，-x） -v可以带正则表达式 
 适用于:  (ncap2), ncbo, ncea,ncecat, ncflint, ncks, ncpdq,ncra, ncrcat, ncwa
 短选项: ‘-v’, ‘-x’
 长选项: ‘--variable’, ‘--exclude’ or ‘--xcl’
 -v 可以带正则表达式。
 如： ,‘-v '^DST'’
 ncks -v 'Q.?' in.nc              # Variables that contain Q
 ncks -v '^Q.?' in.nc             # Variables that start with Q
 ncks -v '^Q+.?.' in.nc           # Q, Q0--Q9, Q01--Q99, QAA--QZZ, etc.
 ncks -v '^Q..' in.nc             # Q01--Q99, QAA--QZZ, etc.
 ncks -v '^Q[0-9][0-9]' in.nc     # Q01--Q99, Q100
 ncks -v '^Q[[:digit:]]{2}' in.nc # Q01--Q99
 ncks -v 'H2O$' in.nc             # Q_H2O, X_H2O 
 ncks -v 'H2O$|CO2$' in.nc        # Q_H2O, X_H2O, Q_CO2, X_CO2 
 ncks -v '^Q[0-9][0-9]$' in.nc    # Q01--Q99
 ncks -v '^Q[0-6][0-9]|7[0-3]' in.nc # Q01--Q73, Q100
 ncks -v '(Q[0-6][0-9]|7[0-3])$' in.nc # Q01--Q73
 ncks -v '^[a-z]_[a-z]{3}$' in.nc # Q_H2O, X_H2O, Q_CO2, X_CO2
7. 缺测值（missing_value）
现在nc文件中的属性missing_value，需要更名为_FillValue
ncrename -a .missing_value,_FillValue inout.nc
8. 压缩（deflation）
 适用于:  ncap2, ncbo, ncea,ncecat, ncflint, ncks, ncpdq,ncra, ncrcat, ncwa
 短选项: ‘-L’
 长选项: ‘--dfl_lvl’, ‘--deflate’
例如：
   ncpdq         in.nc out.nc
9. 运算类型（-y Operation Types）
 适用于:  ncap2, ncra, ncea, ncwa
 短选项: ‘-y’
 长选项: ‘--operation’, ‘--op_typ’
 运算类型：avg, sqravg，avgsqr，max，min，rms（Root-mean-square (normalized by N) ），
rmssdn(Root-mean square (normalized by N-1) ),sqrt(Square root of the mean ),ttl(Sum of values )
例如：   
    ncwa -y min -v prs_sfc in.nc foo.nc

10. 批处理（-y Operation Types）

 适用于:  所有
 短选项: ‘-O’, ‘-A’
 长选项: ‘--ovr’, ‘--overwrite’, ‘--apn’, ‘--append’

四. 命令
1. ncea :   (e: evenly, a: averaging)
    功能 : 对>=2的nc文件求平均。
    例如： ncea -v T,U 1980010100.nc 1980010106.nc 1980010112.nc 1980010118.nc ea.nc
               对变量为T,U的四个时次nc文件求平均
2.

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